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了鮑林關於肽鍵是平直的思想；科裡還和一個研究小組對一種完整的球狀蛋白——溶菌酶作了研究，他們將其切割成細小的片段，在色譜圖上予以分隔，一一進行研究；鮑林指示研究人員將汞那樣的常見重元素的原子摻入蛋白質鏈，以便於進行X光分析；另有一名新同事傑克·科克沃德使用了泰氏電泳儀，蒐集球狀蛋白的電荷分佈和一般特性的有關資訊。1948年與1949年之交的冬天，物理學客座教授赫爾曼·布蘭遜來訪，鮑林安排他詳盡地考察一下蛋白質螺旋結構到底有哪些可能的模型，“看一看我是否遺漏了什麼。”這種模型必須滿足鮑林提出的兩個條件：肽鍵是平直的，氫鍵數取最大值。重要的是，鮑林撤去了布拉格研究組附加的一個條件。他對布蘭遜說，我們沒有足夠的理由可以相信，螺旋結構的每一圖中氨基酸個數一定是一個整數。布蘭遜在懷恩巴姆（此時他尚未受到作偽證的指控）的幫助下，利用自己掌握的數學知識，使用極為精確的建模裝置，開始工作起來，就螺旋結構的課題，構造了幾十種不同的模型。
此時，鮑林將注意力轉到了其他事情上。他於1949年1月開始擔任美國化學學會主席，政治活動佔用他的工作時間更多了。關於鐮狀細胞貧血症的研究已經開花結果。在1949年末
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