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不僅會引起荒誕的哲學，而且會引起異端的宗教”。弗蘭西斯？培根的這些話，對整個社會起到振聾發聵的作用。並且成為促進科學和社會發展的巨大力量。

對知識的兩種看法和態度引起的爭論，不僅停留在口頭上、筆桿子上，而是在現實生活中以血與火譜寫成人類文明發展史上的慷慨悲歌。

法國12世紀以獨立講學而名震一時的彼得？阿貝拉（1072—1142），他主張不依賴神學而獨立研究哲學和學藝，反對教會權威，頌揚人的理智，遭到教會的嚴重打擊。他的學說被斥為異端，著作被焚燬，許多和他一樣具有自由思想的教師，也被驅逐出去。

英國牛津大學教師、著名的思想家羅哲爾？培根（1214—1294），尖銳地批判經院哲學，指出：“當靈魂為罪惡所玷汙時，是不可能安於真理之光的，只能象一隻鸚鵡或饒舌者一樣，重複長期實踐中學來的別人說過的話”。並指出掌握真理有四大障礙：“屈從於權威”，“習慣的影響”，“流行的偏見”，“潛在的無知”。羅哲爾？培根主張用實驗的方法研究自然界，只有透過“經驗才能夠認識現象的原因”。他做過許多有價值的物理和化學的觀察，論述過火藥及其在軍事上的運用，考慮過眼鏡、望遠鏡和顯微鏡的結構，甚至幻想過自動車船、飛行機器等。他的科學思想遭到圍攻，本人也為此被囚禁幾十年之久。

波蘭天文學家尼古拉？哥白尼（1473—1543），提出著名的“太陽中心說”。並且在30多年以後，即1543年公開出版論述這一新的宇宙觀的鉅著《天體執行論》。恩格斯評價說：“哥白尼那本不朽著作的出版，他運用這本書（……）來向自然事物方面的教會權威挑戰。從此自然科學便開始從神學中解放出來”　。“太陽中心說”遭到教會勢力的猛烈抨擊，新教首領馬丁？路德金指責哥白尼：“只有傻瓜才想把整個天文學連底都翻過來。聖經上明明寫著，約書亞喝令其停止不動的是地球而不是太陽”。另一位神學家梅蘭希怒斥地球旋轉運動的說法：“只有那些缺乏虔誠的人才會公開地說出這種話來。一切有善良意志的人都應當接受並順從上帝所啟示的真理”　。

義大利最卓越的思想家之一布魯諾（1548—160