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師培的父親劉貴曾為光緒間舉人，著有《春秋左傳歷譜》、《尚書歷草補演》、《抱甕居士文集》等。母親李汝蘐，是江都學者李祖望的次女，通曉經史。由於家學淵源，劉師培8歲起學《周易》，12歲時已讀畢《四書》、《五經》。

1898年，父親劉貴曾病逝，劉師培便由母親李汝蘐授《爾雅》、《說文》，並向堂兄劉師蒼問學。劉師培聰慧好學，博覽群書，內典道藏、西方哲學，無不涉獵，尤精歷史掌故，在經學方面打下了深厚的功底。1901年，他考取秀才，1902年參加江南鄉試，中舉人。

劉師培是經史世家的傳人，其家藏書如海。劉師培十七歲即全部讀完了家中的藏書，然後論史談經，著書立說，在國學界被譽為少年大師，與年近不惑的章太炎齊名。

劉師培早年喪父，祖母怕他出外吃虧，將他禁錮於家，所以他雖名聲在外，但世人皆不知劉師培何許人也。劉師培因科舉考試失利，辱罵清廷被官府官府通緝，聽說陳獨秀、章士釗等人在上海辦《蘇報》，便來投奔。這日閒暇，陳獨秀到章士釗寓所聊天，忽一滿身汙髒、蓬頭垢面的少年叩門而入，對二人說：“我叫劉師培，從揚州家裡逃出來的。”章、陳二人考其《左傳》上的學問，始信此少年便是劉師培。

章太炎曾評價劉師培的治學道：“常人患不讀書，而申叔讀書過多，記憶太繁，而悟性反少，誠欲著書，宜三二載束書不觀，少忘之而後執筆，庶可增其悟力雲。”

在北大任教的三年間，劉師培講授“中國文學”、“文學史”課程並出版了《中國古文學史講義》。本書的出版使“文選”派在文派之爭中獲得勝利，並在文學史的教學與研究方面成為後世的典範。

劉師培家族幾代傳經，劉師培繼承家學傳統，研究《左傳》，著有《春秋左氏傳古例詮徵》、《春秋左氏傳例略》、《春秋左氏傳答問》、《春秋左氏傳時月日古例考》、《讀左札記》等著作。同時，他還研究《周禮》，著有《周禮古注集疏》、《禮經舊說考略》、《逸禮考》以及《古書疑義舉例補》、《論文札記》等作品，都有較高的學術地位。

劉師培在繼承《左氏》家學的同時，運用近代西方社會科學研究方法和成果，研究中國傳統文化，開拓了傳統文化研究的新境界。他運用進化論思想研究古代社會生活，著有《論小學與社會學之關係》、《讀書隨筆》、《國學發微》、《小學發微補》等作品，具有開創性的意義。

劉師培三十多年的生命歷程中，著作頗豐，其中關於論群經及小學者二十二種，論學術及文辭者十三種，群書校釋二十四種。劉師培去世後，錢玄同等人將劉的文章整理編輯成《劉申叔先生遺書》。

1917年底，北大文、理、法三科各學門先後成立研究所，入研究所學習的學生成為研究員，劉師培兼任了文科研究所國文門的指導教師（類似於現在的研究生導師）。開始，他所指導的研究科目為“文”和“文學史”兩個研究方向，定每月第二週和第四周的週四安排一個小時時間，分別與“文學史”、“文”兩個研究方向的研究員進行研討。後來研討日期稍有調整，但仍是每月分別指導一次。從1918學年開始，劉師培所指導的研究科目調整為“經學”、“史傳”、“中世文學史”、“諸子”四個方向。在所有國文門的教員中，他指導的科目最多，次為黃侃，指導三科，餘者僅擔任一科，如朱希祖、錢玄同、吳梅、周作人等。北大的這一工作為編纂完善的中國政治史和專門史打下了良好基礎。但五四運動發生、蔡元培離京出走時，徐樹錚乘機向北洋政府國務院提出由政府收回北大國史編纂處，直接隸屬國務院，改稱國史館，北大的這項工作被迫中斷。

1919年，北京大學出版了《中國中古文學史》，此書是劉師培在北大中國文學門任教時所編講義，出版後很受學生歡迎，反響極大。

劉師培在《中國中古文學史》中，第一次把中古文學作為獨立的研究物件，篳路藍縷，功不可沒。本書從政治、思想、風俗、時尚等方面闡述了文學發展變遷的大勢和文體文風的演變歷史。本書最大的特點就是廣徵博引，其引證資料的廣博和慎密，堪稱文學史著作的典範，而劉師培對史籍的熟稔程度，也令人歎服。本書以引用資料為主，表達觀點為輔，在寫作方法上，先羅列史料，間或夾雜劉個人的觀點，再選錄相關文章，進行印證，相互呼應。

劉師培是近代研究魏晉玄學的開創者之一，早在1905年，劉師培就在其著述《國學發微》中對魏晉玄學進行了較為全面的論述。魏晉