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三是“為政府出謀獻策”——最後一項實際上是其主要的功能，它是埃及第一個完全有組織的科學智囊團。

第九章　失敗的陰影（3）

科學院分成4個部門：數學部（包括蒙日和拿破崙）、物理和政治經濟部（包括解救過約瑟芬的前督政塔里昂）和文學藝術部（包括德農，未來的盧浮宮藝術館館長）。拿破崙還親自在缺乏人才的埃及從自己的軍官和士兵中選拔合格的科學院成員。

科學院院址設在被沒收的馬穆魯克宮廷，離厄爾費宮僅數英里路程。蒙日、貝託萊和其他院士就居住在這兩個宮廷裡面。同時，在那裡還有植物學、物理學和化學實驗室、科學資料和埃及古玩以及拉丁文、希臘文和阿拉伯文的圖書館。

科學院於8月23日在院長蒙日的主持下舉行了成立儀式，但其實際的院長無疑是副院長拿破崙。拿破崙給科學院的第一個課題是立即為法國軍隊改良麵包烤爐，以提高效率和生產量；研究啤酒花的可能的替代品，以便為軍隊提供啤酒；用最好的辦法淨化取自尼羅河的飲水以及適於埃及使用的風磨和水磨；建立鑄造廠和制硝廠以生產機器、工具和火藥。此外科學院還研究適用於埃及的民事和刑事司法制度和教育制度。拿破崙每週都要親臨科學院數次，能擺脫司令部來到這裡，他總是很高興。

科學院的設立為幫助拿破崙解決軍隊面臨的各種技術難題起到了不可估量的作用，同時，確立了蒙日在他心目中的無可辯駁的地位。蒙日作為政治行政委員會的高階成員控制著埃及大部分的“本地”行政手段；現在，他又主持著在這個國家進行的一切科學研究工作。

回過頭來說，在阿布基爾海戰失敗後不久，8月15日，拿破崙的29歲生日聚會很少有喜慶的氣氛；甚至他的9名副官以及他的養子歐仁·博阿爾內和愁眉苦臉的弟弟路易·波拿巴也只是敷衍了事地對他道了一句生日快樂而已。海軍失敗的陰影似乎籠罩了一切。拿破崙的遠征軍在中東的形勢發生了急劇的變化，埃及被地中海上強大的英國海軍封鎖，迫使拿破崙放棄了他原來制定的進攻印度的計劃。

拿破崙曾經想過，在攻佔了馬耳他和埃及後，回到法國以當代英雄的身份推翻督政府。這在目前看來也是不可能了，法國艦隊的失敗抵消了他前面所取得的一切勝利。拿破崙需要在返回巴黎之前進行新的征服，還有什麼樣的征服比征服聖地（巴勒斯坦）、大馬士革和君士坦丁堡更有影響的呢？

拿破崙開進新徵服的開羅時憂心忡忡，完全不是一個征服英雄應有的模樣。只有蒙日和佈列納知道其中緣由。拿破崙發現埃及所面臨的問題比他原來估計的要大得多，也複雜得多，　包括對埃及人民的反抗情緒的錯誤估計。當備受相思折磨的貝爾蒂埃被准假回歐洲投入他義大利情婦維絲孔蒂（Visconti）的懷抱時，拿破崙也急於回到法國去見約瑟芬。

拿破崙年輕的副官朱諾曾對拿破崙報告說：　約瑟芬和夏爾的風流韻事仍在繼續。這對於本以為噩夢已經過去的拿破崙是一個沉重的打擊。貝爾蒂埃和朱利安都對拿破崙承認：在義大利戰役期間經常看到約瑟芬和夏爾廝混在一起。“一切都昭然若揭，”拿破崙給他的哥哥寫通道，“對心上人產生如此複雜的感情，真是一件可悲的事。”在海軍艦隊覆滅的訊息之外又加上這樣一件事，對拿破崙無疑是雪上加霜。不過倒黴的事還在後面。

拿破崙已經斷了自己在巴黎的政治後路，在督政府裡沒有了朋友。至少他們不會急於前來營救這位被困的英雄，拿破崙悲嘆道：“他們嫉恨我，恨不得我死在這裡才快活。”即使他們打算組建一支新的地中海艦隊前來營救他，建造和修理軍艦也不是朝夕能夠成功的事。即使督政府有條件派出軍隊和艦隻前來埃及救援，難道法國海岸就不需要保護嗎？事實上，拿破崙應該承認由於他的不可一世和（他歷來厭惡的埃及政治家似的）自我炫耀，埃及戰役是失敗了。他沒有能夠像一個成熟的職業軍人那樣精心策劃對埃及的遠征戰役。

拿破崙認為在埃及戰役中已經被殲滅的馬穆魯克軍實際上只是暫時退避三舍而已，東北的易卜拉欣貝伊軍和南面的穆拉德貝伊軍隨時會捲土重來。拿破崙被遍佈埃及的大約2萬多貝伊軍包圍著。德塞已經被派到了尼羅河上游，克萊貝爾在海岸地區。在三角洲的最東面，迪蓋和扎約翁謝克率領著總共4；000多人的部隊在平定梅努夫地區。東北部沙爾黑耶（Salheyeh）周圍地區的雷尼爾力爭和迪蓋協調配合，掃除那個地區的強大的貝都因軍，同時確保尼羅河一線的安全。所有這