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摩爾根有生以來第一次面對課堂上的學生,而且每天都得去教室講課。本科生和研究生的生物學教學由四人分擔。摩爾根是生物學副教授,雅克·洛布是生理學和生理心理學副教授。摩爾根在伍茲霍爾時就結識了洛布,兩人在學術上終生交往甚密。另兩名教師,一個的專業是生理學,還有一個是植物學。
摩爾根每週五天有課,每天至少上兩次,一次講高階生物學,另一次上普通生物學或普通動物學。他又開設了胚胎學系列講座,每週一次;還負責這些課程的實驗室工作,指導博士研究生的研究和博士論文。他組織了一個兩週一次的學術沙龍,漫談近期發表的物學文獻。
要應付這麼繁重的教學任務,最省事的辦法是年年期期都講同一內容,照本宣科,週而復始——但摩爾根不這樣做。相反,他卻願意對課程內容有所修改,以反映他自己的研究成果。1894至1895年在那不勒斯呆了一年之後,他回國來就這麼教書,尤其是在研究生的課堂上。
作為一個教師,摩爾根與威爾遜的風格迥異。威爾遜在布林莫爾執教六年,講課總是經過周密思考,層次分明,順理成章。摩爾根的口頭禪卻是:別管教�
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